Поиск

Прогнозирование применимости ПЦР-ПДРФ-анализа для тестирования сортового многообразия винограда

Авторы: Вафин, Р. Р. Михайлова, И. Ю. Агейкина, И. И.
Краткая информация
Маркер записи n 22 3 4500
Контрольный номер pipr23_no1_ss6_ad1
Дата корректировки 9:20:36 31 марта 2023 г.
Кодируемые данные 230221s2023||||RU|||||||||||#||||# rus0|
Системный контрольный номер RUMARS-pipr23_no1_ss6_ad1
AR-MARS
Служба первич. каталог. ОГБУК АО "Астраханская областная научная библиотека им. Н. К. Крупской"
МАРС
Код языка каталог. rus
Код языка издания rus
rus
Индекс УДК 663.1
Индекс ББК 36.87
Таблицы для массовых библиотек
Вафин, Р. Р.
доктор биологических наук; профессор
Рамиль Ришадович
Российская академия наук. Федеральный научный центр пищевых систем имени В. М. Горбатова. Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
070
Прогнозирование применимости ПЦР-ПДРФ-анализа для тестирования сортового многообразия винограда
Рамиль Ришадович Вафин, Ирина Юрьевна Михайлова, Ирина Игоревна Агейкина
Иллюстрации/ тип воспроизводства 2 рис., 3 табл.
Текст
непосредственный
Библиография Библиогр.: с. 8-9 (10 назв.)
Аннотация Для геноидентификации технических сортов винограда может быть применен молекулярно-генетический анализ по локусу гена UFGT (UDP-glucose: flavonoid 3-O-glucosyltransferase - уридиндифосфат-глюкоза: флавоноид 3-О-глюкозилтрансфераза) Vitis vinifera L. длиной 705 нуклеотидов, насчитывающий 34 полиморфные позиции (1 INDEL и 33 SNPs). Тогда как при ДНК-аутентификации виноматериалов и вин целесообразен анализ локуса меньшей длины (из-за сильной фрагментации остаточных нуклеиновых кислот винограда, экстрагируемых из винного дебриса), затрагивающий 5 детектируемых полиморфных позиций (1 INDEL и 4 SNPs), интерпретация которых может позволить охарактеризовать 13 UFGT-ген-ассоциированных групп не только методом прямого секвенирования специфичного ПЦР-продукта, но и другими подходами, требующими отработки. Поэтому целью настоящего исследования являлась прогнозная оценка применимости ПЦР-ПДРФ-анализа для детекции 5 диагностически значимых полиморфных позиций и последующей идентификации 13 UFGT-ген-ассоциированных групп Vitis vinifera L. при тестировании сортового многообразия винограда, а также производимого из него виноматериала. Выделение ДНК из пробоподготовленного биоматериала может быть выполнено коммерческим набором innuPREP Plant DNA Kit, а постановка ПЦР с праймерами UFGT-F1 и UFGT-R2 - Phire Plant Direct PCR Master Mix. ПДРФ-анализ осуществляется с подобранными эндонуклеазами рестрикции (PstI, BsaXI, BtsIMutI и HinfI). Детекция ПЦР-ПДРФ-фрагментов выполняется визуализацией электрофореграмм в УФ-трансиллюминаторе. Выравнивание и рестрикционное картирование референсных нуклеотидных последовательностей локуса UFGT гена Vitis vinifera L. проведено с применением программ BLAST, ClustalW и NEBcutter V2. 0, с последующим моделированием соответствующих ПЦР-ПДРФ-профилей. В результате исследования установлено, что применимость ПЦР-ПДРФ-анализа для идентификации 13 UFGT-ген-ассоциированных групп Vitis vinifera L. прогнозируемо достигается подбором диагностически ценных эндонуклеаз рестрикции, каждая из которых способна дискриминировать определенную полиморфную позицию, включая последнюю, детектируемую благодаря модификации обратного праймера UFGT-R2, приводящего к искусственно создаваемому сайту рестрикции для HinfI при SNP c заменой цитозина (C) на гуанин (G). Исследования проводились в Межотраслевом научно-техническом центре мониторинга качества пищевых продуктов Всероссийского научно-исследовательского института пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности - филиала Федерального научного центра пищевых систем им. В. М. Горбатова РАН.
Источник рубрики Межотраслевой научно-технический центр мониторинга качества пищевых продуктов Всероссийского научно-исследовательского института пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности, филиала Федерального научного центра пищевых систем им. В. М. Горбатова РАН
AR-MARS
Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности, филиал Федерального научного центра пищевых систем им. В. М. Горбатова РАН
Межотраслевой научно-технический центр мониторинга качества пищевых продуктов
AR-MARS
Федеральный научный центр пищевых систем им. В. М. Горбатова РАН
Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
Межотраслевой научно-технический центр мониторинга качества пищевых продуктов
AR-MARS
Пищевые производства
AR-MARS
Бродильные производства
AR-MARS
Ключевые слова виноград
сорта винограда
тестирование сортов винограда
виноматериалы
идентификация растительного сырья
растительное сырье
идентификация виноматериалов
ДНК-технологии
ПЦР
ПДРФ
ПЦР-ПДРФ-анализ
применение ПЦР-ПДРФ-анализа
секвенирование
исследования
НИИ
научно-исследовательские институты
научно-технические центры
Vitis vinifera L.
нуклеиновая кислота
электрофорез
SNP
локусы гена UFGT
молекулярно-генетический анализ
Михайлова, И. Ю.
научный сотрудник
Ирина Юрьевна
Российская академия наук. Федеральный научный центр пищевых систем имени В. М. Горбатова. Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
070
Агейкина, И. И.
научный сотрудник
Ирина Игоревна
Российская академия наук. Федеральный научный центр пищевых систем имени В. М. Горбатова. Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
070
ISSN 0235-2486
Название источника Пищевая промышленность
Место и дата издания 2023
Прочая информация № 1. - С. 6-9
RU
41417097
20230221
RCR
RU
41417097
20230221
RU
AR-MARS
20230221
RCR
RU
AR-MARS
20230221
Тип документа b
code
year
no
ss
ad
pipr
2023
1
6
1
337
Механизмы повышения и контроля качества пищевой продукции