Поиск

Прогнозная модель сортовой идентификации чая ПЦР-ПДРФ-анализом SNP-маркеров Camellia sinensis

Авторы: Вафин, Р. Р. Михайлова, И. Ю. Агейкина, И. И. Харламова, Л. Н.
Краткая информация
Маркер записи n 22 3 4500
Контрольный номер pipr24_no1_ss74_ad1
Дата корректировки 14:40:25 29 марта 2024 г.
Кодируемые данные 240311s2024||||RU|||||||||||#||||# rus0|
Системный контрольный номер RUMARS-pipr24_no1_ss74_ad1
AR-MARS
Служба первич. каталог. ОГБУК АО "Астраханская областная научная библиотека им. Н. К. Крупской"
МАРС
Код языка каталог. rus
Код языка издания rus
rus
Индекс УДК 663/664
Индекс ББК 36.81
Таблицы для массовых библиотек
Вафин, Р. Р.
доктор биологических наук; профессор
Рамиль Ришадович
Российская академия наук. Федеральный научный центр пищевых систем имени В. М. Горбатова. Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
070
Прогнозная модель сортовой идентификации чая ПЦР-ПДРФ-анализом SNP-маркеров Camellia sinensis
Рамиль Ришадович Вафин, Ирина Юрьевна Михайлова, Ирина Игоревна Агейкина, Лариса Николаевна Харламова
Иллюстрации/ тип воспроизводства 1 табл.
Текст
непосредственный
Библиография Библиогр.: с. 76-77 (15 назв.)
Аннотация Растение вида Camellia sinensis является основным сырьем для производства чайной продукции. Оценка подлинности чайного сырья и готовой продукции может быть осуществлена сортовой идентификацией чая молекулярно-генетическими методами исследования, имеющими широкий арсенал диагностических подходов, в том числе к детекции однонуклеотидных замен (SNP - Single Nucleotide Polymorphism) анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов ДНК, предварительно амплифицированных полимеразной цепной реакцией (ПЦР-ПДРФ). Цель настоящего исследования заключалась в выявлении и картировании полиморфных сайтов рестрикции у 8 SNP-маркеров Camellia sinensis с последующим ПЦР-ПДРФ-профилированием встречаемых генотипов и постаналитической оценкой китайских сортов чая на предмет их генотипической принадлежности и идентифицируемости. 117 эксклюзивных сортов чая, идентифицируемых с помощью 8 SNP-маркеров (1_SNP_2, 1_SNP_1, 3_SNP_14, 3_SNP_15, 1_SNP_13, 2_SNP_14, 1_SNP_5 и 2_SNP_4), послужили модельными объектами теоретико-аналитического исследования биоинформационной направленности, в ходе которого были подобраны диагностически значимые эндонуклеазы рестрикции, способные детектировать SNP и идентифицировать генотипы анализируемых маркеров. Таким образом установлена возможность детектирования полиморфных позиций 8 SNP-маркеров Camellia sinensis методом ПЦР-ПДРФ-анализа, обоснованная картированием выявленных полиморфных сайтов рестрикции и последующим профилированием встречаемых генотипов. Установленная возможность открывает перспективу для моделирования способа сортовой идентификации чая по анализируемым SNP-маркерам с последовательными этапами пробоподготовки исследуемых образцов чая, экстракции нуклеиновых кислот Camellia sinensis и постановок ПЦР-ПДРФ с гель-электрофорезной детекцией. Постаналитическая оценка китайских сортов чая на предмет их генотипической принадлежности и идентифицируемости по SNP-маркерам с полиморфными сайтами коммерчески доступных эндонуклеаз рестрикции позволила установить как идентифицируемые сорта чая с охарактеризованными уникальными комбинациями генотипов, так и неидентифицируемые сорта чая, распределенные по SNP-ассоциированным группам. SNP-маркеры, полиморфные позиции которых затрагивают сайты рестрикции коммерчески недоступных эндонуклеаз, могут быть проанализированы одной из модификаций ПЦР-ПДРФ - dCAPS (Derived Cleaved Amplified Polymorphic Sequences).
Примеч. о целев. назн. 16+
Источник рубрики Российская академия наук
Федеральный научный центр пищевых систем имени В. М. Горбатова
Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
Межотраслевой научно-технический центр мониторинга качества пищевых продуктов
AR-MARS
РАН
ФНЦ пищевых систем им. В. М. Горбатова
ВНИИ пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
Межотраслевой научно-технический центр мониторинга качества пищевых продуктов
AR-MARS
РАН
ФНЦ пищевых систем им. В. М. Горбатова
ВНИИПБиВП
Межотраслевой НТЦ мониторинга качества пищевых продуктов
AR-MARS
Межотраслевой научно-технический центр мониторинга качества пищевых продуктов ВНИИ пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности ФНЦ пищевых систем им. В. М. Горбатова РАН
AR-MARS
Межотраслевой НТЦ мониторинга качества пищевых продуктов ВНИИПБиВП ФНЦ пищевых систем им. В. М. Горбатова РАН
AR-MARS
Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности Федерального научного центра пищевых систем имени В. М. Горбатова Российской академии наук
AR-MARS
Пищевые производства
AR-MARS
Основные процессы и аппараты пищевых производств
AR-MARS
Ключевые слова Camellia sinensis
чай
идентификация чая
сортовая идентификация чая
SNP-маркеры
ПЦР
ПДРФ
оценка китайских сортов чая
китайские сорта чая
полиморфные сайты рестрикции
генотипическая принадлежность сортов чая
генотипическая принадлежность чая
исследования
НИИ
научно-исследовательские институты
научно-технические центры
Михайлова, И. Ю.
научный сотрудник
Ирина Юрьевна
Российская академия наук. Федеральный научный центр пищевых систем имени В. М. Горбатова. Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
070
Агейкина, И. И.
научный сотрудник
Ирина Игоревна
Российская академия наук. Федеральный научный центр пищевых систем имени В. М. Горбатова. Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
070
Харламова, Л. Н.
кандидат технических наук; научный сотрудник
Лариса Николаевна
Российская академия наук. Федеральный научный центр пищевых систем имени В. М. Горбатова. Всероссийский научно-исследовательский институт пивоваренной, безалкогольной и винодельческой промышленности
070
ISSN 0235-2486
Название источника Пищевая промышленность
Место и дата издания 2024
Прочая информация № 1. - С. 74-77
RU
41417097
20240311
RCR
RU
41417097
20240311
RU
AR-MARS
20240311
RCR
RU
AR-MARS
20240311
Тип документа b
code
year
no
ss
ad
pipr
2024
1
74
1
337
Пищевая биотехнология