| Индекс УДК | 663/664 |
|
Прогнозная модель сортовой идентификации чая ПЦР-ПДРФ-анализом SNP-маркеров Camellia sinensis Рамиль Ришадович Вафин, Ирина Юрьевна Михайлова, Ирина Игоревна Агейкина, Лариса Николаевна Харламова |
|
| Аннотация | Растение вида Camellia sinensis является основным сырьем для производства чайной продукции. Оценка подлинности чайного сырья и готовой продукции может быть осуществлена сортовой идентификацией чая молекулярно-генетическими методами исследования, имеющими широкий арсенал диагностических подходов, в том числе к детекции однонуклеотидных замен (SNP - Single Nucleotide Polymorphism) анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов ДНК, предварительно амплифицированных полимеразной цепной реакцией (ПЦР-ПДРФ). Цель настоящего исследования заключалась в выявлении и картировании полиморфных сайтов рестрикции у 8 SNP-маркеров Camellia sinensis с последующим ПЦР-ПДРФ-профилированием встречаемых генотипов и постаналитической оценкой китайских сортов чая на предмет их генотипической принадлежности и идентифицируемости. 117 эксклюзивных сортов чая, идентифицируемых с помощью 8 SNP-маркеров (1_SNP_2, 1_SNP_1, 3_SNP_14, 3_SNP_15, 1_SNP_13, 2_SNP_14, 1_SNP_5 и 2_SNP_4), послужили модельными объектами теоретико-аналитического исследования биоинформационной направленности, в ходе которого были подобраны диагностически значимые эндонуклеазы рестрикции, способные детектировать SNP и идентифицировать генотипы анализируемых маркеров. Таким образом установлена возможность детектирования полиморфных позиций 8 SNP-маркеров Camellia sinensis методом ПЦР-ПДРФ-анализа, обоснованная картированием выявленных полиморфных сайтов рестрикции и последующим профилированием встречаемых генотипов. Установленная возможность открывает перспективу для моделирования способа сортовой идентификации чая по анализируемым SNP-маркерам с последовательными этапами пробоподготовки исследуемых образцов чая, экстракции нуклеиновых кислот Camellia sinensis и постановок ПЦР-ПДРФ с гель-электрофорезной детекцией. Постаналитическая оценка китайских сортов чая на предмет их генотипической принадлежности и идентифицируемости по SNP-маркерам с полиморфными сайтами коммерчески доступных эндонуклеаз рестрикции позволила установить как идентифицируемые сорта чая с охарактеризованными уникальными комбинациями генотипов, так и неидентифицируемые сорта чая, распределенные по SNP-ассоциированным группам. SNP-маркеры, полиморфные позиции которых затрагивают сайты рестрикции коммерчески недоступных эндонуклеаз, могут быть проанализированы одной из модификаций ПЦР-ПДРФ - dCAPS (Derived Cleaved Amplified Polymorphic Sequences). |
| Название источника | Пищевая промышленность |
| Место и дата издания | 2024 |
| Прочая информация | № 1. - С. 74-77 |
