| Индекс УДК | 663.1 |
|
Идентификационный потенциал вариабельного локуса гена P5CS ячменя для оценки гаплотипической принадлежности основного сырья для пивоварения Ирина Юрьевна Михайлова, Рамиль Ришадович Вафин, Ирина Игоревна Агейкина |
|
| Аннотация | Широкое сортовое многообразие ячменя, в том числе пивоваренного направления, - результат многовековой селекции данной зерновой культуры, одомашненной человеком практически первой. Для оценки его генетического разнообразия применяют различные типы молекулярных маркеров, подбираемых в зависимости от поставленных задач и технологической оснащенности лаборатории. Из уровня техники известен способ идентификации 13 гаплотипов гена P5CS Hordeum Vulgare L. интерпретацией детектируемых полиморфных позиций, насчитывающих 16 SNPs и 25 INDELs в анализируемом локусе длиной 1066 нуклеотидов. Будучи оптимальной мишенью для тестирования зерна и солода на предмет их гаплотипической принадлежности, указанная протяженная область может и вовсе не амплифицироваться из образцов ДНК ячменя, подвергшихся фрагментации уже на начальных этапах пивоварения. Поэтому основной целью исследования являлась оценка идентификационного потенциала вариабельного локуса гена P5CS Hordeum Vulgare L. небольшого размера, ограниченного сконструированным набором праймеров, инициирующих амплификацию ПЦР-продукта длиной 323 bp. Экстракцию ДНК ячменя из зерна и солода проводили коммерческим набором "innuPREP Plant DNA Kit". Постановку ПЦР выполняли коммерческим набором "Encyclo Plus PCR Kit" с последующей гель-электрофорезной детекцией амплификата, визуализированного в УФ-трансиллюминаторе. Выравнивание анализируемых нуклеотидных последовательностей и подбор идентификационно значимых эндонуклеаз рестрикций проводили с использованием онлайн-программ CLUSTALW и NEBcutter V2. 0 соответственно. В результате проведенного исследования оценен идентификационный потенциал вариабельного локуса гена P5CS Hordeum Vulgare L. ограниченной длины. При этом установлено, что разрешающая способность секвенируемого ампликона сводится к идентификации 8 уникальных гаплотипов и 2 групп-гаплотипов, тогда как ПЦР-ПДРФ-анализ с пятью подобранными рестриктазами способен идентифицировать 5 уникальных гаплотипов и 3 групп-гаплотипов. Таким образом, анализируемая область гена, фланкируемая сконструированными праймерами P5CS-F1 и P5CS-R1, может служить диагностической мишенью для установления гаплотипической принадлежности ячменного сырья и прослеживаемости начальных этапов производства пива. |
| Название источника | Пищевая промышленность |
| Место и дата издания | 2022 |
| Прочая информация | № 9. - С. 26-30 |
