Поиск

AlphaFord в арсенале современного медицинского химика

Авторы: Иваненков, Я. А. Евтеев, С. А. Малышев, А. С. Терентьев, В. А. Безруков, Д. С. Ерещенко, А. В. Корженевская, А. А. Загрибельный, Б. А. Шегай, П. В. Каприн, А. Д.
Краткая информация
Маркер записи n 22 3 4500
Контрольный номер uchm24_to93_no3_ss0_ad1
Дата корректировки 13:00:52 29 апреля 2024 г.
Кодируемые данные 240412s2024||||RU|||||||||||#||||# rus0|
Системный контрольный номер RUMARS-uchm24_to93_no3_ss0_ad1
AR-MARS
Служба первич. каталог. Научная библиотека Чувашского государственного университета
МАРС
Код языка каталог. rus
Код языка издания rus
rus
Индекс УДК 661.12
Индекс ББК 35.66
35.66
Таблицы для массовых библиотек
Таблицы для массовых библиотек
Иваненков, Я. А.
кандидат биологических наук; ведущий научный сотрудник; руководитель лаборатории
Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена - филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации; Всероссийский научно-исследовательский институт автоматики имени Н. Л. Духова
070
AlphaFord в арсенале современного медицинского химика
Я. А. Иваненков, С. А. Евтеев, А. С. Малышев [и др.]
Иллюстрации/ тип воспроизводства 20 рис., 5 табл.
Текст
непосредственный
Библиография Библиогр.: с. [33-36] (154 назв. )
Аннотация Создание новых малых лекарственных молекул - важная и сложная междисциплинарная проблема. На ранних этапах ее решения используют методы хемоинформатики и биоинформатики, что позволяет сократить затраты на поиск соединения-лидера. В арсенале медицинского химика методы моделирования стыковки и молекулярной динамики занимают особое место, так как позволяют прогнозировать возможный механизм связывания потенциального лиганда с белковой мишенью. Однако для моделирования стыковки необходимо располагать пространственной структурой изучаемой мишени. В настоящее время доступны базы данных трехмерных структур, но многие белковые молекулы еще не описаны, поэтому возникает потребность в моделировании их строения. Разработано несколько компьютерных подходов, позволяющих решать эту задачу. Алгоритм AlphaFold, работающий на базе методов машинного обучения, рассматривается научным сообществом в качестве наиболее эффективного для прогнозирования трехмерных структур молекул белков. Однако границы его применения в области медицинской химии, в частности для виртуального скрининга, остаются неясными. В данном обзоре кратко описаны методы, позволяющие прогнозировать трехмерные структуры белков, а также рассмотрены примеры использования алгоритма AlphaFold с целью разработки и рационального отбора потенциальных лигандов на стадию биологического тестирования. Особое внимание уделено публикациям, в которых приведены результаты экспериментальной валидации подхода. На основании проведенного анализа сформулированы основные проблемы в обозначенной области и возможные пути их решения.
Химическая технология
AR-MARS
Фармацевтические производства
AR-MARS
Ключевые слова AlphaFold
лекарства
малые лекарственные молекулы
машинное обучение
медицинская химия
молекулярный докинг
нейронные сети
Евтеев, С. А.
ведущий научный сотрудник
Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена - филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации; Всероссийский научно-исследовательский институт автоматики имени Н. Л. Духова
070
Малышев, А. С.
научный сотрудник
Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена - филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации; Всероссийский научно-исследовательский институт автоматики имени Н. Л. Духова
070
Терентьев, В. А.
научный сотрудник
Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена - филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации; Всероссийский научно-исследовательский институт автоматики имени Н. Л. Духова
070
Безруков, Д. С.
кандидат физико-математических наук; доцент
Химический факультет Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова
070
Ерещенко, А. В.
научный сотрудник
Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена - филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации; Всероссийский научно-исследовательский институт автоматики имени Н. Л. Духова
070
Корженевская, А. А.
младший научный сотрудник
Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена - филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации
070
Загрибельный, Б. А.
аспирант
Химический факультет Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова
070
Шегай, П. В.
кандидат медицинских наук; заместитель генерального директора по науке; руководитель центра
Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена - филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации
070
Каприн, А. Д.
академик; доктор медицинских наук; профессор; генеральный директор; заведующий кафедрой
Московский научно-исследовательский онкологический институт имени П. А. Герцена - филиал Национального медицинского исследовательского центра радиологии Министерства здравоохранения Российской Федерации; Российский университет дружбы народов
070
ISSN 0042-1308
Название источника Успехи химии
Место и дата издания 2024
Прочая информация Т. 93, № 3. - С. [5-36]
RU
42813093
20240412
RCR
RU
42813093
20240412
RU
AR-MARS
20240412
RCR
RU
AR-MARS
20240412
Тип документа b
code
year
to
no
ss
ad
uchm
2024
93
3
0
1
244
Ivanenkov, Ya. A.
Evteev, S. A.
Malyshev, A. S.
Terentiev, V. A.
Bezrukov, D. S.
Ereshchenko, A. V.
Korzhenevskaya, A. A.
Zagribelnyy, B. A.
Shegai, P. V.
Kaprin, A. D.