Поиск

Тушение флуоресценции карбоксифлуоресцеинов в составе ковалентных конъюгатов с олигонуклеотидами

Авторы: Поведайло, В. А. Ступак, А. П. Цыбульский, Д. А. Шманай, В. В. Яковлев, Д. Л.
Подробная информация
Индекс УДК 53:51
535.37
Тушение флуоресценции карбоксифлуоресцеинов в составе ковалентных конъюгатов с олигонуклеотидами
[Текст]
В. А. Поведайло [и др.]
Аннотация С использованием уравнений Штерна-Фольмера выполнен анализ процессов динамического и статического тушения флуоресценции молекул 6- (2', 7'-диметокси-4', 5'-дихлор) карбоксифлуоресцеина (JOE) нуклеозидами дезоксиаденозином, дезоксицитидином, дезоксигуанозином, тимидином и дезоксиуридином в растворе трис-ацетатного буфера. Из пяти нуклеозидов лишь для дезоксигуанозина выявлен преимущественно статический механизм тушения флуоресценции. Показано, что квантовые выходы флуоресценции в растворе буфера для 5- и 6-карбоксифлуоресцеина (FAM), а также 5- и 6-JOE, ковалентно связанных жестким (4-транс-аминоциклогексанол) линкером с олигонуклеотидом, больше, чем в случае их аналогов с гибким (6-аминогексанол) линкером. Полученные данные свидетельствуют о том, что тушение флуоресценции в системах с гибким линкером осуществляется преимущественно вследствие ван-дер-ваальсова взаимодействия между флуорофором и гуанином. Увеличение количества последовательно расположенных гуанинов, связанных линкером с красителем в составе олигонуклеотидов и их дуплексов, приводит к снижению квантового выхода флуоресценции. На основании квантово-химических расчетов с использованием программы Gaussian 09 дана интерпретация смещения спектров поглощения и флуоресценции 5-FAM и 5-JOE в низкочастотную область относительно 6-изомеров.
Название источника Журнал прикладной спектроскопии
Место и дата издания 2017
Прочая информация Т. 84, № 3. - С. 434-442